El jugador parecía ser uno de los mejores proyectos del Cacique, pero tras una serie de lesiones y no ser considerado por el técnico Gustavo Quinteros para la presente temporada, Carlos Villanueva dejó Macul y arribó a Huachipato en donde registra en el Torneo Nacional solo 61 minutos en cancha en un total de cuatro duelos.
En diálogo con AS Chile, el formador de Villanueva, Luis Pérez Franco, destacó que «es un chico profesional, que se entrena bien y tiene mucha calidad técnica. Es parecido a (Carlos) Palacios y siento que en Colo Colo le dieron muy pocos minutos. Tiene muchas condiciones», concluyendo que «nunca debería haber salido del club».

Pérez sostiene que el canterano: «tiene una técnica envidiable» y que es necesario que comience a sumar minutos en Huachipato. «Tiene cosas de Valdivia, de Palacios, y hay pocos jugadores así en Chile. Es importante que lo puedan rescatar», afirmó.
«A lo mejor hay que hablarle. O meterle un psicólogo para que vuelva a ser el de antes. Insisto: es un tremendo jugador», concluyó.
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— Sintonía Alba Radio #ColoColo (@SintoniaAlba) August 11, 2023
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